Rasierer Schnelles Lesezuordnung mit Empfindlichkeitssteuerung
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Rasierer Ranking & Zusammenfassung

Rasierer Stichworte

Analyse DNA-Sequenz Dna. Genom Genomsequenz

Rasierer Beschreibung

Rasierer ist ein praktisches und zuverlässiges Dienstprogramm, das für die Kartierung von Millionen kurzer Genom auf einem Referenzgenom entworfen wurde. Es wurde mit Fokus auf das Abbilden der Sequenzierung der nächsten Generation erstellt. Rasierer sucht nach Übereinstimmungen von Liegestunden mit einer prozentualen Identität über einem bestimmten Schwellenwert, wobei es Spiele mit Mismatches sowie Lücken erkennt. Rasierer verwendet einen K-Mer-Index aller Liegen und zählt gemeinsame K-Mers der Reads und das Referenzgenom in Parallelogrammen. Jedes Parallelogramm mit einer K-Mer-Anzahl über einem bestimmten Schwellenwert löst eine Überprüfung aus. Bei Erfolg werden die genomische Annahme und die Leseanzahl in die Ausgabedatei gespeichert und geschrieben.

Rasierer Zugehörige Software