Quasiecomb. Erzeugen und Analysieren virale Quasis-Quasisleistungen, die Rekombination ausgesetzt sind.
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Quasiecomb. Ranking & Zusammenfassung

Quasiecomb. Stichworte

Inferenz Rekombination

Quasiecomb. Beschreibung

QuasiRecomb ist eine leichte Anwendung, die in der Befehlskonsole ausgeführt wird, und simuliert ein Markov-Modell zum Erzeugen von viralen Quasisdecys. Es beschreibt die Erzeugung der viralen Quasismee und ein Verfahren, um seine Parameter durch Analysieren der Sequenzierungsdaten der nächsten Generation abzuschließen. Das Modell wird auf simulierten Daten validiert und zeigt den Vorteil, dass der Rekombinationsprozess explizit berücksichtigt, und getestet wird, indem er sich durch die Anwenden der von experimentellen HIV-Proben erhaltenen Lesungen getestet. Es bietet eine Implementierung des EM-Algorithmus, um maximal ein Posteriori-Schätzungen der Modellparameter und ein Verfahren zu finden, um die Verteilung von Virusstämmen in den Quasisdekunden abzuschätzen.

Quasiecomb. Zugehörige Software