Prorata Quantitative Shotgun-Proteomikanalyse leicht gemacht.
Jetzt downloaden

Prorata Ranking & Zusammenfassung

Prorata Stichworte

Analysieren Proteomics Post Processor. Proteomics-Analyse. Proteomik quantitative Proteomics. Proteomics Data Analysis. Proteomics-Daten Datenverarbeitung Proteomics Data Manager. Proteomics-Daten verwalten quantitativer proteomic. enzymatische Kennzeichnung. enzymatisch Spektrometrie basierte Proteomik Schrotflinte-Bildschirmschoner Schrotflinte Proteomics Data Simulation. Proteomics-Daten simulieren Quantitatives Genom Proteomik-Datenanalysator quantitativ quantitative Analyse Quantitative Risikoanalyse.

Prorata Beschreibung

Prorata ist ein einfacher Antrag, der zur Automatisierung der Datenverarbeitung und -analyse für quantitative Schrotflinte-Proteomics ausgelegt ist. Die quantitative Schrotflinte-Proteomik versucht, die Fülle von Proteinen in den Behandlungszellen relativ zu ihrer Fülle in den Referenzzellen zu schätzen. In solchen Experimenten sind die Referenzzellen mit stabilen Isotopen über metabolische Kennzeichnung, enzymatische Kennzeichnung oder chemische Kennzeichnung markiert und mit den Behandlungszellen in äquivalenten Mengen gemischt. Nach der Proteolyse werden die Proben mit mehrdimensionaler Flüssigkeitschromatogramm-Tandem-Massenspektrometrie analysiert. Die erfassten Tandem-Massenspektren werden verwendet, um die Aminosäuresequenz und nach-translatorische Modifikationen von proteolytischen Peptiden zu identifizieren. Prorata nimmt die Peptid-Identifikationsergebnisse und die Massenspektraldaten als Eingabe an. An diesem Punkt, Prorata akzeptiert die Ausgabe nur vom Programm dtaselect als Identifikationsergebnis und die Massenspektraldaten im MZXML-Format. Prorata führt alle Schritte zur Schätzung der Protein-Fülle-Verhältnisse und deren Vertrauensintervalle aus. Diese Schritte umfassen: Extraktion ausgewählter Ionenchromatogramme, Erfassung von chromatographischen Peaks, Abschätzung der Peptid-Überflussverhältnisse und der Abschätzung der Protein-Überflutungsverhältnisse. Die Ergebnisse von jedem dieser Schritte können manuell über die prioratische grafische Benutzeroberfläche überprüft werden.

Prorata Zugehörige Software