Prioreditor. Analysieren Sie DNA-Sequenzen mit diesem Werkzeug.
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Prioreditor. Ranking & Zusammenfassung

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Prioreditor. Beschreibung

Prioreditor ist eine praktische, einfach zu bedienende Workbench, die speziell entwickelt wurde, um Ihnen bei der Analyse der Regulierungsregion und der Transkriptionsfaktor-Bindungsdiskussion zu helfen. Das Programm betont die Verwendung von Positionsvorbereitungen, um die Suche nach Bindungsstellen in Richtung Teilen von DNA-Sequenzen zu fokussieren, die als wahrscheinlicher als echte Funktionsstellen enthalten. Positionsvorbereitungen können durch Manipulieren, Vergleichen und Kombinieren von Informationen zu verschiedenen Merkmalen, einschließlich der phylogenetischen Erhaltung, dnase überempfindlichen Stellen, Wiederholungsregionen, Nukleosomenpositionen und anderen epigenetischen Daten, physikalischen Eigenschaften der DNA-Helix, Entfernung von der Transkriptionstartseite oder Nähe zu anderen bekannten Bindungsstellen und vieles mehr. Daten können vom UCSC-Genombrowser (oder importiert aus Datei) heruntergeladen und mit der grafischen Benutzeroberfläche visualisiert werden. Es ist auch möglich, die Discovery- oder Motiv-Scannen von De Novo-Motiven mit bekannten Motivmodellen durch Anschluss mit lokal installierten Programmen durchzuführen. Die Ergebnisse können dann visualisiert, analysiert, analysiert und nach dem Prioreditor verarbeitet werden.

Prioreditor. Zugehörige Software