Peakfinder lokalisiert Peaks (Koholing-Bindungsstellen) in Hefe-Chip-Microarry-Daten
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Peakfinder Ranking & Zusammenfassung

Peakfinder Stichworte

Finder Locator Ändern Sie die Protokollbindung. zeigen Protokoll-Bindung Protokollbindung. Gipfel Bindung auswählen Skibindung. Bindung umsetzen. Renderman Bindung. Flexible Bindungsmechanismus Datenbindung. Bindung C ++ zu lua Bindungs Bindung erstellen Bindung generieren Bindungsbibliothek. QT 4 Bindung. .NET-Bindung Bindungsset Twin Peaks Screensaver. Zwillingsgipfel OpenCl API Bindung. QT-Bindung. Python-Bindung Spitze lokalisieren Gipfel finden Peak Locator. Chromatographische Peaks anzeigen. Chromatographische Peaks Analysis. Datenbank-API-Bindung Tri Peaks. ja Text Mosaikersteller Säureabfall 1.0. n73 Klingelton Schneider Download-tor-Browser USB sicher entfernen Adobe Acrobat5 Serial. Nero Plugin Lame. PHP-Autor NRG-Datei-Extraktor. Sims3pack Body Shop. Universal-Ethernet-Treiber Bluetooth-Treiber ivt

Peakfinder Beschreibung

Der Peakfinder-Antrag wurde entwickelt, um ein Werkzeug zu sein, das Peaks (Koholing-Bindungsstellen) in Hefe-Chip (Chromatin-Immunpräzipitation) -Mikroarrerdaten lokalisiert. PeakFinder ist ein Genom-Visualisierungstool, das Microarray-Verhältnis-Daten für "Peaks" durchsucht. Die Peaks werden unter Verwendung einer geglätteten Kurve gefunden, die interaktiv gewählt werden kann. Nucleotid-Inhalt mit einem angegebenen Bewegungsfenster kann zusammen mit den Ergebnissen der Microarray angezeigt werden. Das Programm ist fast generisch für jedes Genom, hat jedoch immer noch ein paar Hefe-Parameter. Eingabedateien: - GenomeIndex.dat-Datei: Die Koordinaten erzählen den Standort jedes Chromosoms innerhalb des Genoms. Der CENTROMERE-Standort ist ebenfalls angegeben. - "Feature-Koordinaten" Excel-Arbeitsblatt: Säulen A, B und C müssen Name, COORD1, COORD2 sein. Die Koordinaten sind für jedes Merkmal Genomkoordinaten. - "Ratios" Excel-Arbeitsblatt mit Microarray-Daten: Spalte A muss "unbemerkt" sein. Die Verhältnisdaten werden in der letzten Spalte angenommen. Die Merkmale "UniNAME" -Werzwerte müssen die in der Funktions-Koordinaten des Feature-Koordinaten angegebenen Arbeitsblatts festlegen. - Verzeichnis mit Nukleotidsequenzen, einer Datei für jedes Chromosom. Die Sequenzdaten können im FASTA-Format mit einem DeprLine oder einfach einer ASCII-Datei sein. Die Namen der Dateien müssen CHR * oder CHRNN * sein. Beispielsweise, chr05.fsa oder chrviii_562639.askii. Entweder "altes" oder "neues" Dateiformat aus der Saccharomyces-Genom-Datenbank ist akzeptabel. - PeakFinder.ini befindet sich im Verzeichnis C: \ Dokumente und Einstellungen \ Lokale Einstellungen \ Anwendungsdaten \ Stowersinstitut \ PeakFinder Ausgabedateien: - Das Diagramm wird automatisch in der Zwischenablage platziert, wenn die Option Bitmap oder Metafile ausgewählt ist, und kann sofort in eine andere Anwendung eingefügt werden, nachdem sie angezeigt wird. (Deaktivieren Sie das Kontrollkästchen AUTO SAVE SAVE KIRELL, DIESE AUTOMATISCHE ANZEIGEN DER GRACHE IN DER ABGABELBARD). Drücken Sie ansonsten die Schaltfläche Speichern auf dem Tabellenblatt, um das Diagramm in einer angegebenen GIF-Datei zu speichern. - Die Schaltfläche Speaks Speichern auf der Registerkarte Speaks kann ausgewählt werden, um eine Peaks.csv-Datei zu speichern, die in Excel geöffnet werden kann. - Die Schaltfläche "Alle" der Taste "Alle" auf dem RAWData-Tabsheet ergibt sich in einem Satz von Dateien, die erstellt wurden. Geben Sie normalerweise ein neues Verzeichnis an und es enthält diese Dateien, wenn die Verarbeitung abgeschlossen ist: ratiofilename.dat, ratiofilename-chromosomenn.gif (nn = 01 bis 16), und ratiofilename-peaks.csv, wo ratiofilename der Name des Verhältnisses Excel ist Datei, die auf dem Rohdaten-Tabsheet angegeben ist.

Peakfinder Zugehörige Software