Nemo

Untersuchen Sie die Geschichte der phänotypischen Sets
Jetzt downloaden

Nemo Ranking & Zusammenfassung

Anzeige

  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • Siddhartha Jonnalagadda
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 3.5 MB

Nemo Stichworte


Nemo Beschreibung

Nemo ist eine voraussaugende, genetisch explizite, individuelle, individuelle und stochastische Simulationssoftware, die speziell aufgebaut ist, um die Entwicklung von Lebensgeschichte / phänotypischen Eigenschaften und der Bevölkerungsgenetik in einem flexiblen (Meta-) Bevölkerungsrahmen zu untersuchen. Nemo implementiert viele verschiedene Lebenszyklusereignisse und eventuelle Eigenschaften mit einer Vielzahl von genetischen Architekturen. Artenwechselwirkung zwischen einem Parasiten und seinem Wirt können auch modelliert werden (d. H. Zytoplasmatische Inkompatibilität, die Endosymbiont: Wolbachia induziert). All dies ist in einem flexiblen Metapopulationsmodell gerahmt, das patchspezifische Tragkapazitäten, Dispergierraten, stochastische Extinktions- / Erntetraten und der demografischen Stochastizität ermöglicht. Populationen können während einer Simulation dynamisch modifiziert werden, sodass Bevölkerungsgifte, Patch-Fusion / Fisson, Bevölkerungsausdehnung usw. ermöglicht. Die räumlich heterogene Auswahl an quantitativen Merkmalen kann auch modelliert werden. Haupteigenschaften: Merkmale: neutrale Marker (microSatellite, snps) schädliche Mutationen (mit lokusspezifischen festen oder zufälligen Effekten und Dominanz) Quantitative Merkmale (neu in v2.2.0) (mit pleiiotropem quantitativen loci) Dispergal (männlich- und weiblichspezifischer Ausdruck) Wolbachia (mütterlich vererbte zytoplasmatische Inkompatibilität, die Endosymbiont induziert) Lebenszyklusereignisse: Zucht (mit Promiskuität, Polygyny, Monogamie, Selbst- und Klonen von Paarungssystemen) Disperse (Migrant-Pool / Propagulierungspool-Inselmodell, 1D- und 2D-Gittermodelle usw.) Altern (mit Decke-Patch-Verordnung) Rentabilitätsauswahl (basierend auf schädlichen Mutationen oder zur stabilisierenden Auswahl auf quantitativen Merkmalen) Extinktion / Ernte Patch Fusion / Fassung Kreuzung Design (Full-Sib / Half-Sib-Designs)


Nemo Zugehörige Software