NAMD ist ein paralleler molekularer Dynamikcode, der für die Hochleistungssimulation großer biomolekularer Systeme ausgelegt ist. Basierend auf Charme ++ Parallelobjekte, NAMD-Waagen auf Hunderte von Prozessoren auf high-End-parallelen Plattformen und Zehner von Prozessoren auf Rohstoffclustern mit Gigabit-Ethernet. NAMD verwendet das beliebte molekulare Grafikprogramm VMD für Simulation Setup und Trajektory-Analyse, ist aber auch mit Bernstein, Charmm und X-Plor dateikompatibel. Geben Sie namd ein, um zu sehen, was es wirklich fähig ist!
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