Musite Noch ein anderes Bioinformatik-Tool, um Ihnen bei Ihrer Arbeit zu helfen.
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Musite Ranking & Zusammenfassung

Musite Stichworte

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Musite Beschreibung

Musite ist ein einfach zu bedienender, Java-basierter Antrag, der ein Bioinformatik-Tool zur Vorhersage von allgemeinen und kinasspezifischen Proteinphosphorylationsstellen anbietet. Haupteigenschaften: Um die verschiedenen Einschränkungen der aktuellen Werkzeuge bei der Beantragung von Proteomen anzugehen und die große Größe experimentell verifizierter Phosphorylierungsstellen besser auszunutzen, haben wir ein einzigartiges Standalone-Anwendungssystem Musite entwickelt, das speziell für die große Vorhersage von allgemein entwickelt wurde und kinasspezifische Phosphorylierungsstellen. Musite genutzte lokale Sequenz Ähnlichkeitsmuster (KNN-Scores) und generische Merkmale (Stichtrors-Scores und Aminosäurerfrequenzen) von Phosphorylierungsstellen und ein umfassender Maschinenlernen, um Vorhersagen vorzunehmen. Wir haben die vorherige Fundgebung bestätigt, dass Phosphorylierungsstellen vorzugsweise in ungeordneten Regionen auf Phosphoperomics-Daten in sechs Organismen angeordnet sind. Musite ist das erste Werkzeug, das das Dienstprogramm für das Training eines Phosphorylierungs-Site-Vorhersagemodells von den eigenen Daten der Benutzer bereitstellt, und unterstützt die kontinuierliche Anpassung der Stringungsstufen. Musite bietet eine benutzerfreundliche grafische Benutzeroberfläche, die es den Biologen leicht macht, Vorhersagen auf automatisierter Mode auszuführen. Anwendungen von Musite auf sechs Proteomen führten Zehntausende putative Phosphorylierungsstellen mit hoher Stringenz. Diese Vorhersagen bieten nützliche Hypothesen für experimentelle Validierungen. Cross-Validation-Tests zeigen, dass Musite vorhandene Instrumente erheblich zum Vorhersagen der allgemeinen Phosphorylierungsstellen übertreibt und zumindest mit denen vergleichbar ist, um kinasspezifische Phosphorylierungsstellen vorherzusagen. Darüber hinaus kann Musite als Open-Source-Software auch als offene Plattform für den Bau von Machine Lernantrag auf PHOSPORYLATION-SITE-Vorhersage serviert werden.

Musite Zugehörige Software