MrBayes.

ein Werkzeug, um Ihnen bei Ihrer bayesarischen Abschätzung der Phylogenie zu helfen.
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MrBayes. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Name des Herausgebers:
  • Sebastian Hoehna
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 494 KB

MrBayes. Stichworte


MrBayes. Beschreibung

MrBayes ist eine einfache, benutzerfreundliche Anwendung, die speziell für die Bayesische Abschätzung der Phylogenie entwickelt wurde. Das Programm nimmt als Eingabe einer Zeichenmatrix in einem Nexus-Dateiformat auf. Der Ausgang ist mehrere Dateien mit den vom MCMC-Algorithmus abgetasteten Parameter. MrBayes kann die Informationen in diesen Dateien für den Benutzer zusammenfassen. Haupteigenschaften: Eine gemeinsame Befehlszeilenschnittstelle für Macintosh, Windows und Unix-Betriebssysteme; umfangreiche Hilfe über die Befehlszeile; Fähigkeit, Nukleotid, Aminosäure, Restriktionsstelle und morphologische Daten zu analysieren; Mischen von Datentypen, wie molekularen und morphologischen Zeichen, in einer einzigen Analyse; Eine allgemeine Methode zum Zuweisen von Parametern über Datenpartitionen; Eine Fülle von evolutionären Modellen, darunter 4 x 4, Doublet und Codon-Modelle für Nukleotiddaten und viele der Standard-Rate-Matrizen für Aminosäuredaten; Schätzung positiv. Selecterte Sites in einem vollständig hierarchischen Bayes-Framework.


MrBayes. Zugehörige Software