Mdl. Molekulardynamiksprache
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Mdl. Ranking & Zusammenfassung

Mdl. Stichworte

Simulation Sprache Molekulare Dynamiksimulation Molekulare Dynamik

Mdl. Beschreibung

Ermöglicht es Benutzern, Molecular Dynamics (MD) -Simulationen auf einem hohen Niveau darzustellen Die Molecular Dynamics Language (MDL) soll den Benutzern ermöglichen, dass Benutzer mit molekularen Dynamik (MD) auf einem hohen Niveau darstellen können. Dazu gehört die Möglichkeit, direkt mit laufenden Simulationen und Prototyp-neuen Integrations-Systemen mit mehreren verschiedenen Methoden zu interagieren, einschließlich Objekten und Funktionen, die Positions- und Geschwindigkeitssätze aktualisieren. Die Sprache baut auf Python auf und verwendet einen Satz von SWIG-umwickelten Bibliotheken aus dem Software-Framework-Protomol, das zum Teil entwickelt wurde, um den starken Leistungsanforderungen an Langstrecken-Kraftberechnungen zu erfüllen. Das Hinzufügen und Testen neuer Force-Evaluation-Algorithmen werden durch das modulare Aufbau von MDL sowie neue Simulationsprotokolle geholfen. Die API enthält Funktionalität, um auf Simulationsdaten, Ein- und Ausgabedaten in unterschiedlichen Dateien und Formaten zuzugreifen, Datenplots hinzuzufügen, einzelne Integratoren verschiedene Arten von Kräften hinzuzufügen, vorhandene Integratoren aus dem Protomol-Framework in Python verwenden und Datenvektoren in schnelle numerische Arrays umsetzen .

Mdl. Zugehörige Software