Mauve MAUVE - Multiple Genome Sequenzausrichtung. Genomsequenzvergleich.
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Mauve Ranking & Zusammenfassung

Mauve Stichworte

Reihenfolge Genom Genomsequenzvergleich

Mauve Beschreibung

MAUVE ist ein System, um mehrere Genomausrichtungen in Gegenwart großer evolutionärer Ereignisse wie Umrüstung und Inversion effizient zu errichten. Mehrere Genomausrichtung kann eine Grundlage für die Erforschung vergleichender Genomik und das Studium der evolutionären Dynamik in einem völlig neuen Maßstab bieten. Die Ausrichtung von ganzen Genomen ist ein grundsätzlich anderes Problem, als kurze Sequenzen auszurichten. MAUVE wurde mit der Idee entwickelt, dass ein Multiple Genome Aligner nur bescheidene Rechenressourcen erfordern sollte. Es verwendet algorithmische Techniken, die gut skalieren, in der Menge an Reihenfolge, die ausgerichtet ist. Beispielsweise kann ein Paar Y. Pestisgenomen in weniger als einer Minute ausgerichtet werden, während eine Gruppe von 9 divergierenden Enterobakteriengenomen in wenigen Stunden ausgerichtet werden kann.

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