MEPS. Algorithmus zum Finden von maximalen Tandem-Wiederholungen
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MEPS. Ranking & Zusammenfassung

MEPS. Stichworte

DNA-Sequenz DNA-Sequenzanalyse.

MEPS. Beschreibung

MREPs ist eine flexible und effiziente Software zum Identifizieren serieller Wiederholungen (normalerweise als Tandem-Wiederholungen) in DNA-Sequenzen. MREPs basiert auf einem gemischten kombinatorischen / heuristischen Paradigma. Der Kern von MREPs besteht aus umfangreichen kombinatorischen Algorithmen (in beschrieben), um alle Wiederholungen zu finden, die bestimmte mathematische Eigenschaften überprüfen. Dies versichert die Erschöpfung des Ansatzes. Diese Wiederholungen werden dann an eine heuristische Behandlung vorgelegt, um eine biologisch relevanter Darstellung der Wiederholungen zu erhalten. MREPs verfügt über einen Auflösungsparameter, der es erlaubt, "Fuzzy" -Ein-Wiederholungen zu berechnen. Bei metaphorischen Begriffen spielt dieser Parameter die Rolle von "Lupe", so dass die genomische Sequenz "herauszoomen, um mehr lose Wiederholungen zu berechnen. Holen Sie sich MREPS und geben Sie es ein Gehen, um seine Fähigkeiten vollständig zu beurteilen!

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