Kvit Chromosomen mit Hilfe dieses Werkzeugs anzeigen
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Zuschauer Aussicht Chromosom Genomsequenz

Kvit Beschreibung

CVIT, kurz für das Chromosomen-Ansicht-Tool ist als Perl-Anwendung ausgelegt, mit dem PNG-Bilder schneller generiert werden können, die Merkmale auf einer Vielzahl von Karten oder auf genomischen Sequenzen anzeigen. Es ist absichtlich einfach und nicht interaktiv, obwohl es möglich ist, Cvit-Innere, beispielsweise interaktive Webseiten, einzuwickeln. Der Eingang besteht aus einem oder mehreren Dateien im GFF3-Format. Die Daten müssen Aufzeichnungen enthalten, die ein oder mehrere "Chromosomen" beschreiben (die eine Verbindungsgruppe, ein Petuedomolekül, BAC, eine beliebige Art von zusammenhängenden DNA-DNA- oder sogar einer Proteinstruktur darstellen können). Diese "Chromosomen" sind das Rückgrat, auf dem sich die Funktionen befinden. Cvit zeigt ein beliebiges anhängendes Koordinatensystem, einschließlich Basispaare, Centimorgans (genetische Karten) und Centimcclintoks (zytogenetische Karten). Die Koordinaten können (kleinste bis zum größten) oder rückständigen (größten zu kleiner) vorwärts laufen. Der Ausgang besteht aus einem PNG-Bild des Chromosoms (S) und Merkmals, einem Legendenbild und einer Liste von Merkmalskoordinaten.

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