Karyoskop Visualisierung von Ausdrucksdaten in einem Ganzgenomkontext.
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Karyoskop Ranking & Zusammenfassung

Karyoskop Stichworte

Zuschauer Gen-Daten anzeigen. Ausdrucksdaten

Karyoskop Beschreibung

Caryoskop ist eine wiederverwendbare Java-UI-Komponente und ein Satz von Analyse-Dienstprogrammen, Befehlszeilen-Tools und eine Anwendungs-GUI zum Anzeigen von Genexpressionsdaten in einem Vollgenomkontext. Caryoscope ist ein Softwarepaket, mit dem Sie numerische Daten in Abhängigkeit von der genomischen Position anzeigen und erkunden können. Beispielsweise wurde das Caryoskop verwendet, um Microarray-Daten auf einen Satz von Chromosomen zeichnen, so dass Änderungen in der DNA-Kopiernummer Regionen des Chromosomenverlusts oder -vervielfällungen innerhalb des Genoms von Tumorzellen (NAT-Genet. 1999 Sep; 23 (1) : 41-6). Darüber hinaus können Microarray-Datenmessmess-mRNA-Expressionsniveaus auch in einem genomischen Kontext mit Caryoskop (PNAs 2002 DEC 10; 99 (25): 16144-9) visualisiert werden. Die mit Caryscope angesehenen Daten müssen nicht auf Microarray-Daten beschränkt sein - Jede Art von numerischen Daten, die als Funktion der genomischen Position dargestellt werden können, können mit Caryoskop visualisiert werden. Holen Sie sich Caryoskop und versuche es zu sehen, worum es geht!

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