Kartograph

ein Programm zur genetischen Verbindungsanalyse
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Kartograph Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Russell L. Malmberg
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 472 KB

Kartograph Stichworte


Kartograph Beschreibung

MapMaker ist ein Satz von Anwendungen, die verwendet werden können, um genetische Verknüpfungskarten aufzubauen und das Gen-Mapping durchzuführen. In einem leichten Paket geliefert, bündelt es zwei Befehlszeilenwerkzeuge, nämlich mapmaker / exp und mapmaker / qtl. Der erste verfügt über Optionen, um die primären Verbindungsgruppen zu erzeugen und die Leistung zu analysieren, um die dominanten, co-dominanten und rezessiven Marker zu bestimmen, während Letztere Ihnen dabei hilft, Gene zu kardieren, indem Sie die zuvor generierten Verbindungskarten verwenden. MapMaker / ExP arbeitet mit flachen ASCII-Textdateien, die den von verschiedenen Arten von Kreuzentypen abgeleiteten Datenset enthalten (Backcross, Intercross, Testcross, Haploid-Daten). Die andere Anwendung funktioniert nur mit F2-Intercross- und Backcross-Daten. Sie beginnen, indem Sie den Datensatz für die Analyse vorbereiten und in MapMaker / Exp laden. Die Anwendung verfügt über ein breites Spektrum von Befehlen, mit dem Sie genetische Sequenzen, um genetische Sequenzen zu listen, zu bearbeiten, zu bearbeiten, zu bearbeiten, die Markierungen in einer Sequenz einzusetzen. Sie können es verwenden, um eine paarweise Analyse für Paare von Markierungen durchzuführen und Multi-Point-Analyse durchzuführen. Es kann einem Chromosom Markierungen zuweisen und den Mapping-Status einiger Loci anzeigen. Das Programm verfügt über Genotyping-Fehlererkennungsfunktionen und ermöglichen Ihnen, mithilfe der Haplotypen in einem einzelnen Datensatz teilzunehmen. Es kann die Daten in einer Datenbank speichern und den Status und die Zuordnungsergebnisse auf Ihrem Computer speichern. MapMaker / qtl wird für das Gen-Mapping verwendet, mit verschiedenen Merkmalsbefehlen und ermöglicht es Ihnen, die erhaltenen Daten in PostScript zu speichern, QTL-Karten und so weiterzuspeichern.


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