Jsittecriptor. Informationen von PDBs extrahieren
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Extraktion Extrakt Informationsabzug PDB

Jsittecriptor. Beschreibung

JSITTEESSCRIPTOR wurde als zugängliches Paket von Tools erstellt, mit dem Benutzer helfen können, Chemie- und Koordinateninformationen aus PDB-Dateien zu extrahieren. Die Bindungsstellebereiche werden mit dem Raster-basierten Schema extrahiert. JsitteTesScriptor ist ein kleines Dienstprogramm, das mit Hilfe der Java-Programmiersprache entwickelt wurde. Haupteigenschaften: Generation von PocketMatch-basierten Vektor-Deskriptor für eine Bindungsstelle Spezifikation der Site als Ligand-Nachbarschaft - (Ligand-Code, Name und Ketten-ID) Spezifikation der Site als PDB-Subset-Nachbarschaft mit regulären Ausdrücken Spezifikation mehrerer Atome atome, die eine Bindungsstelle Batch-Modus-Verarbeitungsdatei erfasst Eingabeparameter über die XML-Datei +, die an die XSD-Spezifikation entspricht einfache und erweiterbare Softwarearchitektur für zukünftige Entwicklung

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