JCompoundMapper.

Fingerprinting-Algorithmen für Ihre Verwendung
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JCompoundMapper. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Name des Herausgebers:
  • Georg Hinselmann
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 10.7 MB

JCompoundMapper. Stichworte


JCompoundMapper. Beschreibung

JCompoundMapper wurde erstellt, um beliebte Fingerabdruckalgorithmen für chemische Grafiken bereitzustellen. Unter diesen Graphen finden wir die Tiefe-First-Suchfingerabdrücke, Kürzeste-Pfadfingerabdrücke, erweiterte Konnektivitätsfingerabdrücke, Autokorrelationsfingerabdrücke (z. B. CATS2D), radiale Fingerabdrücke (z. B. MOLPRINT2D), geometrische Molprint, Atompaare und Pharmakophor-Fingerabdrücke. JCompoundMapper bietet Exporteure für mehrere Formate für maschinelle Lernwerkzeuge wie libsvm, liblinear und weka. Die Anwendung ermöglicht eine Parametrierung wie Suchtiefe, Abstandsabschnitte oder Atomtypen. Im Falle von Hash-Fingerabdrücken können Sie die Größe des Hash-Raums konfigurieren. JCompoundMapper für die Berechnung von Ähnlichkeitsmatrizen für Clustering-Ansätze oder als Eingabeformat für libsvm Die Software kann als leichte JAR-Bibliothek oder eine eigenständige ausführbare Größe verwendet werden JCompoundMapper basiert nur auf Open Source-Software mit einer liberalen Lizenz. Es verwendet das chemische Expert-System des Chemieentwicklungskits. Das Hauptziel des Programms ist: · Bereitstellung von Standard-Fingerabdruck-Implementierungen für Data Mining-Experimente · Open Source-Implementierungen mit einer genauen Definition · Einfach zu verwendendes Befehlszeilenwerkzeug für die beschriebenen Aufgaben · Bieten Sie eine Grundlage für die Entwicklung neuer Fingerabdruckcodierungen, die beispielsweise an Algorithmen mit genau demselben Etikettalgorithmus verglichen werden können.


JCompoundMapper. Zugehörige Software

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