Isoem. Java-Tool, um Ihnen bei Ihrer Forschung zu helfen
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Isoem. Ranking & Zusammenfassung

Isoem. Stichworte

Ausdruck Reihenfolge Genexpression Gen RNA-Sequenz

Isoem. Beschreibung

Die ISOEM-Anwendung ist ein Java-basiertes Werkzeug, das verwendet werden kann, um IsoForm- und Genexpressionsniveaus von der Hochdurchsatz-Transcriptome-Sequenzierung (RNA-SEQ) -Daten abzuleiten. ISOEM verwendet einen neuartigen Erwartungsmaximierungsalgorithmus, der Lese-Disambiguierungsinformationen ausnutzt, die durch die Verteilung der während des Sequenzierungsbibliotheksvorbereitungen erzeugten Einfügungsgrößen bereitgestellt werden, und nutzt den Basisqualitäts-Scores, Strang- und Lesepaarinformationen. Empirische Experimente zu synthetischen Datensätzen zeigen, dass der Algorithmus vorhandene Methoden der Isoform- und Genexpressionsschätzung der Isoform- und der Genexpressionsschätzung von RNA-SEQ-Daten erheblich übertrifft.

Isoem. Zugehörige Software