Hapedit. Haplotyp-Montage-Viewer mit Sitz in Java
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Hapedit. Ranking & Zusammenfassung

Hapedit. Stichworte

PHP asp. HTML HTML-Editor. PHP-Editor Montage ASP-Editor Bewertung DNA-Sequenz HTML-Bearbeitung Haplotyp.

Hapedit. Beschreibung

HAPEDIT ist ein Instrument, das speziell aufgebaut ist, um dem Benutzer zu helfen, die Genauigkeit der Haplotyp-Baugruppe einzuschätzen. Dies erfolgt mit den Sequenzierungstechnologien der nächsten Generation. HAPEDIT ist ein Tool, das mit Hilfe der Java-Programmiersprache erstellt wurde und auf mehreren Plattformen ausgeführt wird. Haupteigenschaften: Anstelle einer haploiden Konsenssequenz werden Haplotyp-Segmente oben im Haplotyp-Baugruppenfenster angezeigt. Eine Qualitätszahlung, die die Genauigkeit für montierte Haplotyp-Segmente bewertet, ist unter den Haplotyp-Segmenten gezeigt. Ein Readame ist farbig, was die Sequenzierungstechnologie widerspiegelt, die für das Lesen verwendet wird. Basis-Anrufe werden nach ihren Qualitätswerten differell gefärbt. Dies erleichtert einen Benutzer, um unterqualtige Basisanrufe zu finden. Durch Doppelklicken auf einen bestimmten Bereich im Fenster Assembly-Navigationsfenster kann ein Benutzer die detaillierte Ansicht der Region sehen, die im Haplotyp-Baugruppenfenster angezeigt wird. Missbaute Haplotype-Segmente können in Stücke gebrochen werden. Die Verbindung von Haplotyp-Segmenten, die durch ergänzende Daten bestätigt werden, ist durch einfache Mausvorgänge aktiviert. Die Zusammensetzungsraten der Sequenzierungstechnologien werden analysiert und in Balkendiagrammen angezeigt. In ähnlicher Weise werden auch die Sequenz- und Klonabdeckung in Kreisdiagrammen zusammengefasst.

Hapedit. Zugehörige Software