Genosuite.

Führen Sie proteogenomische Analyse durch und kombinieren Sie mehrere Algorithmusergebnisse.
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Genosuite. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Preis:
  • Free
  • Name des Herausgebers:
  • By Dhirendra Kumar
  • Betriebssysteme:
  • Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP
  • Zusätzliche Anforderungen:
  • None
  • Dateigröße:
  • 33 MB
  • Downloads insgesamt:
  • 22

Genosuite. Stichworte


Genosuite. Beschreibung

Genosuite ist ein Rahmen, der für die proteogenomische Analyse entwickelt wurde. FDRScore-basierte Strategie wird verwendet, um Ergebnisse aus mehreren Suchalgorithmen zu integrieren. Das prokaryotische proteogenomische Werkzeug (PPT) wird als Teil des Genosuite-Frameworks entwickelt. PPT ist für die Suche nach neuen Übersetzungen in prokaryotischen Genomen und hängt von der basierenden Massenspektrometrie-basierten Proteomics-Daten und der damit verbundenen Genomsequenz ab. Die Merkmale umfassen für 4 Open Source-Algorithmen konfiguriert, um die Datenbanksuche nach Peptididentifikation durchzuführen, und jede Kombination des 4-Algorithmus kann gewählt werden, listet die genom-Suchespezifischen Peptide (neuartige Peptide), spektrale Übereinstimmungen können für die Qualitätsbewertung visualisiert werden, listet sich aus Die neuen Proteine und Änderungen der vorhandenen Protein-Annotationen und ein visueller genomischer Kontext der neuen Peptide können ebenfalls erzeugt werden.


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