Genemir Unified Suche nach Säuger-MicroRNA-Zielvorhersagen.
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Genemir Ranking & Zusammenfassung

Genemir Stichworte

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Genemir Beschreibung

Die Genemir-Softwareanwendung ist ein Instrument, das an Biologen und Bioinformatiker ausgerichtet ist, die Vorhersage- und Ausdrucksmuster in Sätzen von MicroRnas und Genen finden möchten. Das Programm arbeitet mit Maus- und menschlichen Zielvorhersage- und Ausdrucksdaten. Eine von zwei Arten von Abfrage kann durch Auswahl: · Ein oder mehrere Mikrornas; · Ein oder mehrere Gene oder Transkripte; bzw. erhalten: · Eine Liste von Genen, die vorausgesagt werden, dass sie von den ausgewählten MICRORRNAS angerufen werden; · Eine Liste von Micrornas, die vorausgesagt werden soll, um die ausgewählten Gene sowie eine vollständige Liste der von diesen MicroRnas ausgerichteten Gene zu zielen. Jedes dieser Abfragen kann von den Filtern modifiziert werden, wodurch der Benutzer einen der Vorhersagealgorithmen auswählen / deaktivieren kann, und die Schwellenkriterien angeben, die den Satz von MicroRnas oder Gene ermitteln, die zurückgegeben werden. Ausdruckspiegel jedes Elements in dem Ausgangssatz sowie der gemittelte Expression aller Gene in diesem Set können als Histogramm betrachtet werden. Histogramme anzeigen Expressionsniveaus in verschiedenen Geweben, die im GNF-Symatlas-Datensatz gemessen werden (siehe Datentypenabschnitt), wobei die Ausdruckswerte jedes Sondensatzes durchschnittlich, wobei das gleiche GEN darstellt. Externe Ausdrucksdaten können auch importiert und auf dieselbe Weise angezeigt werden (siehe Abschnitt Expression Trends-Abschnitt und Ladeausdruckdatenabschnitt). Jedes Element in dem Ergebnissatz kann mit externen Webressourcen verknüpft sein. Eine beliebige Liste von Genen gemäß dem im Abschnitt Konvertierungsdateiformat beschriebenen Format kann von der Konvertierungs-IDs-Funktion in einem von vier verschiedenen Genkennungen verarbeitet werden: RefSeq, GEN-Symbol, GNF / Affymetrix und Ensembl. Gib Genemir einen Versuch, zu sehen, was wirklich fähig ist!

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