Flapjack

Studiengenotypen mit diesem Programm.
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Flapjack Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • BSD License
  • Name des Herausgebers:
  • SCRI Plant Bioinformatics Group
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 19.1 MB

Flapjack Stichworte


Flapjack Beschreibung

Flapjack ist eine komplexe Anwendung, die in der Lage ist, eine Anzahl alternativer grafischer Genotypansichten bereitzustellen. Basierend auf der Eingabe von Karten-, Genotyp- und Merkmalsdaten-FLAPJACK können eine Reihe alternativer grafischer Genotypansichten mit individuellen Allelen bereitstellen, die von Staat, Frequenz oder Ähnlichkeit mit einer bestimmten Standardlinie gefärbt sind. Flapjack unterstützt eine Reihe von Wechselwirkungen mit den Daten, einschließlich grafisch beweglicher Linien oder Markierungen um das Display, Insertionen oder Deletionen von Daten sowie Sortieren oder Clustering von Leitungen durch Genotypähnlichkeit mit anderen Zeilen oder durch Merkmalpunkte. Alle Karten-basierten Informationen wie QTL-Positionen können an grafische Genotypen ausgerichtet sein, um die zugehörigen Haplotypen zu identifizieren. Alle Ergebnisse werden in einem XML-basierten Projektformat gespeichert und können auch als Rohdaten oder grafisch als Bilddateien exportiert werden. Wir haben effiziente Datenspeicherstrukturen entwickelt, die einen Hochgeschwindigkeitszugriff auf jede Teilmenge der Daten bereitstellen, was zu einer schnellen Visualisierung unabhängig von der Größe der Daten führt.


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