Fastsimcoal

Schnelle sequentielle Markov-Koalesziermittel-Simulation genomischer Daten.
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Fastsimcoal Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Laurent Excoffier
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 1.5 MB

Fastsimcoal Stichworte


Fastsimcoal Beschreibung

Fastsimcoal ist eine kleine, einfache, einfache Eingabeaufforderungsanwendung, die speziell entwickelt wurde, um die genetische Vielfalt für verschiedene Arten von Markern entlang der großen genomischen Regionen für beide anwesenden oder alten Proben effizient zu erzeugen. Es enthält einen Parameter-Sampler, der seine Integration in die Einschätzung des Bayesian- oder Wahrscheinlichkeitsparameters ermöglicht. Fastsimcoal kann sehr komplexe evolutionäre Szenarien einschließlich einer beliebigen Migrationsmatrix zwischen den Mustern, historischen Ereignissen, die sich der Bevölkerungsgröße, der Bevölkerung, der Bevölkerungsfusion und der Spaltung, den Beimischungsereignissen, Änderungen in der Migrationsmatrix, oder Änderungen der Bevölkerungswachstumsraten ermöglichen. Die Zeit der Probenahme kann für jede Probe unabhängig spezifiziert werden, sodass eine serielle Probenahme in derselben oder in verschiedenen Populationen ermöglicht.


Fastsimcoal Zugehörige Software