Explorase R-Werkzeug zum Analysieren von biologischen Daten
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Explorase Stichworte

Analyse Biologie multivariate Analyse Erforschen

Explorase Beschreibung

Explorase wurde speziell als Open Source-R-basiertes Instrument für die explorative multivariate Analyse von Systembiologie-Daten entwickelt. Es bietet eine GUI auf der Analysefunktionalität, die von R und dem Bioconductor-Projekt bereitgestellt wird. Die Explorase ist so konzipiert, dass Biologen zugänglich ist, die Omikdaten im Zusammenhang mit metabolischen und regulatorischen Netzwerken analysieren. Haupteigenschaften: bietet eine biologische GUI-an-R-Analysefunktionalität, z. B. Entfernungsmaßnahmen, Clustering, Musterfindung und Modellierung. integriert die Analyse mit interaktiven Grafiken mit Ggobi. verarbeitet transkriptomische, metabolomische und proteomische Daten. vereinfacht das Laden experimenteller Daten in R und Ggobi. unterstützt die Speicherung von Listen von "interessanten" Entitäten für zukünftige Sitzungen. Links sortierbare Tische der Entitätsmetadaten an Ggobi-Parzellen nach Farbkodierung. bietet einen automatischen Zugriff auf ATGenEsearch, die Webschnittstelle zu MetnetDB. spart berechnete Statistiken.

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