Ermelinj.Analysieren von Gen-Sets mit dieser Anwendung. | |
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Ermelinj. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- Freeware
- Name des Herausgebers:
- Paul Pavlidis
- Betriebssysteme:
- Windows All
- Dateigröße:
- 13.7 MB
Ermelinj. Stichworte
- Analysator Analyse Ausdruck Genexpression Gen Anwendung analysieren Sets Gene-Set analysieren Gene Set finden. Extrakt Gen Subset GEN-Subset-Sucher. Griff-Gen-Teilmenge Gen-Daten anzeigen. GEN-Daten anzeigen. Genexpression analysieren Genkorrelation. Gen korrelieren Gene analysieren Genorganisation Genvisualisierung. Vergleichen Gene. Genvergleicher Genmuster Kandidatengen Genmutation simulieren Gen benachbart Gen Annotation Gene Ontology-Datenbank. Gen-Ontologie Gene Network erstellen Gene Network Generator. Geninformation Genprodukt-Assoziation Gen-Krankheits-Assoziation GEN-Identifizierer-Übersetzer. Genfunktionsvorhersage Genidentifikation Genstruktur analysieren Genstruktur Analysator Genapper Genreihenfolge Vergleich Genreihenfolge vergleichen Geninhalt abgeleitet Analysieren Sie das Protein-kodierende Gen Genauswahl Analysieren von genetischen Datensätzen analysieren 16S rRNA-Gensequenz Ancestral Gene Cluster. Gencluster-Rechner Ahnen-Gen Gen-Cluster Gendaten analysieren GEN-Datenanalyse. Expression Micro-Array-Daten Gene-Marker analysieren. Gentransfer Simulieren Sie das GEN-Netzwerk wachsen Genduplikation Analysieren von Genfrequenzdaten Gene-Diversitäten schätzen. Testgen-Diversitäten testen. Genvielfalt Gensequenz Gen-Gen-Interaktion Gene Sequenzname Gen-Cluster-Zuverlässigkeit. Modifizierungs-Gen analysieren Krankheitsgen kartieren Gene visualisieren Gene erforschen Gene anzeigen.
Ermelinj. Beschreibung
Ermelinj ist ein praktisches, einfach zu bedienendes Tool, mit dem Sie die Analyse von Gen-Sets in Expression Micro-Array-Daten oder anderen genomweiten Daten durchführen können, die zu Rankings von Genen führen. Ein typisches Ziel ist es, festzustellen, ob bestimmte biologische Wege in den Daten "etwas Interessantes tun". Die Software soll von Biologen mit wenig oder keinem Informatikhintergrund verwendet werden. Haupteigenschaften: Implementierung mehrerer Methoden zur Gen-Set-Analyse: Überdachungsanalyse Eine Resampling-basierte Methode, die Gen-Scores verwendet Eine Rang-basierte Methode, die Gen-Scores verwendet Eine Resampling-basierte Methode, die die Korrelation zwischen Genexpressionsprofilen (einer Art von "Cluster-Anreicherungsanalyse" verwendet) verwendet. Gene-Sets empfangen statistische Scores (p-Werte), und mehrere Testkorrektur werden unterstützt. Unterstützung der GEN-Ontologie-Terminologie; Benutzer können wählen, welche Aspekte zu analysieren. Benutzerdateien verwenden einfache Textformate. Benutzer können Gen-Sets ändern oder neue erstellen. Die Ergebnisse können innerhalb der Software visualisiert werden. Es ist einfach, mehrere Analysen desselben Datensatzes mit unterschiedlichen Einstellungen zu vergleichen. Benutzerdefinierbare Hyperlinks werden an externe Websites bereitgestellt, um ein effizientere Surfen der Ergebnisse zu ermöglichen. Für Programmierer gibt es eine Befehlszeilenschnittstelle sowie eine einfache Anwendungs-Programmierschnittstelle, mit der die Emerinej-Funktionalität in Ihren eigenen Code angeschlossen werden kann
Ermelinj. Zugehörige Software
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