Clustal X.

Diese Anwendung verfügt über ein Allzweck-Mehrfach-Sequenz-Ausrichtungsprogramm für DNA- oder Proteine.
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Clustal X. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • The European Bioinformatics Institute
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 4.7 MB

Clustal X. Stichworte


Clustal X. Beschreibung

Clustal X ist ein fortgeschrittenes Programm, das sich mit mehreren Sequenzausrichtungen für Proteine und DNA befasst. Das Programm wurde als GUI für Clustalw entwickelt, das Programm führt eine detaillierte Sequenzanalyse durch, während auch viele Dienstprogramme für ordnungsgemäße Vergleiche anbieten SwissProt, NBRF / PIR, Pearson (FASTA), GCG / MSF (Pileup), Clustal (* .aln), GCG9 / RSF und GDE. Während des Importvorgangs versucht Clustal X zu erkennen, ob die Sequenzen Nukleotide oder Aminosäuren sind, aber es gibt keine tatsächliche Garantie, dass die Wahl korrekt ist. Kluger Hervorhebung wichtiger ElementeSonce Die Quelldatei wurde geladen, die Sequenzausrichtung wird im Hauptfenster des Programms angezeigt. Das integrierte Farbschema dient dazu, konservierte Merkmale hervorzuheben, wodurch sie über lebhafte Farben herausgegeben werden. Um den Inhalt der Sequenzen zu unterscheiden, wird empfohlen, dass Sie eine größere Schriftart verwenden. Dies führt zu einer vergrößerten Sequenzansicht, wodurch es leichter ist, seine Zusammensetzung zu erkennen. Einfache AusrichtungsprozessDie Operationen, die vom Programm erlaubt sind, machen eine ganze Liste; Sie können eine Sequenz an eine vorhandene Ausrichtung anhängen, ein Fragment einschneiden oder einfügen sowie nach einer Zeichenfolge suchen oder vorhandene Lücken entfernen. Außerdem können Sie Ausrichtungen über eine der folgenden Methoden ausführen: Komplett (die Reihenfolge wird eine vollständige Analyse unterzogen), Leitbaum nur oder eine Neuausrichtung der ausgewählten Sequenzen und / oder Rückstände. Es wird empfohlen, dass Sie vor dem Starten eines Ausrichtungsprozesses alle Parameter (neue Lücken, Proteinlücken) zurücksetzen, damit die Ergebnisse abschließend zu sein. Analysieren von Daten und erhalten Sie eine Ausrichtungsqualitäts-ScoreOnone der wichtigsten Anzeigen der Analyse, ist die Ausrichtung der Qualität, die für jede Spalte einzeln aufgetragen ist. Eine hohe Punktzahl bezeichnet eine gut konservierte Säule, während niedrige Erhaltungsniveaus durch eine niedrigere Punktzahl angezeigt werden. In der Schlussfolgerung hängt die Analyse von einer Vielzahl von Parametern ab, das gemäß dem wissenschaftlichen Zweck eingestellt werden sollte, der durchgeführt werden muss. Das Programm ist definitiv die große Wahl für Wissenschaftler, sowie Studenten, die einen Träger aus der DNA-Sequenzierung machen möchten. Bewertet von Andreea Matesi, letztes Updated am 21. Juli 2014


Clustal X. Zugehörige Software