Chimerabuster. Ein nützliches Tool für die Chimäre-Sequenzanalyse
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Chimerabuster. Ranking & Zusammenfassung

Chimerabuster. Stichworte

Reihenfolge Fasta Sequenzanalysator.

Chimerabuster. Beschreibung

Chimerabuster ist ein Antrag, der speziell entwickelt wurde, um mutmaßliche chimäre Sequenzen in Klonbibliotheken mit hoher Abdeckung zu finden. Die Chimären werden während der PCR-Amplifikation gebildet und sind Sequenzen, die aus zwei Fragmenten (oder mehr) bestehen, die von zwei anderen Sequenzen (übergeordneten Sequenzen) abgeleitet sind. Somit müssen für Chimeras zum Bilden beide übergeordneten Sequenzen während des Amplifikationsprozesses vorhanden sein. Die vorhandenen Chimärenprogramme abfragen externe Sequenzdatenbanken zur Suche nach übergeordneten Sequenzen. Für eine große Anzahl der Sequenzen ist es jedoch schwierig, mit hoher Wahrscheinlichkeit zu schließen, dass sie aus verschiedenen elterlichen Sequenzen entstanden waren, da in den Datenbanken wie Genbank oder RdP keine ausreichend nahe Verwandten vorhanden sind. Da Chimerabuster vollständig in der Java-Programmiersprache geschrieben ist, sollten es keine Probleme beim Laufen auf einer Vielzahl von Plattformen geben.

Chimerabuster. Zugehörige Software