 | Carnac.Vorhersage der Sekundärstruktur für einen Satz homologer RNA-Sequenzen |
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Carnac. Ranking & Zusammenfassung
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- Lizenz:
- Freeware
- Name des Herausgebers:
- Bonsai Bioinformatics group
- Betriebssysteme:
- Windows All
- Dateigröße:
- 309 KB
Carnac. Stichworte
Carnac. Beschreibung
Carnac ist ein Software-Tool zur Analyse der hypothetischen Sekundärstruktur einer Familie homologer RNA. Es zielt darauf ab, vorherzusagen, ob die Sequenzen tatsächlich eine gemeinsame sekundäre Struktur teilen. Wenn diese Struktur existiert, kann Carnac dann eine große Menge der gefalteten Stiele korrekt wiederherstellen. Der Eingang ist ein Satz einzelsträngiger RNA-Sequenzen, die nicht ausgerichtet werden müssen. Die Faltstrategie stützt sich auf ein thermodynamisches Modell mit Energieminimierung. Es kombiniert Informationen, die von lokal konservierten Elementen der Primärstruktur und gegenseitige Informationen zwischen Sequenzen mit Kovariationen stammen. Holen Sie sich Carnac und probieren Sie es selbst, um zu sehen, wie nützlich es, dass es eigentlich für Sie sein kann!
Carnac. Zugehörige Software
