Bowtie für Linux.

Bowtie für Linux ist ein ultraschneller, erinnerungs-effizienter kurzer Lesezeichen
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Bowtie für Linux. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Ben Langmead
  • Website des Verlags:
  • Betriebssysteme:
  • Linux
  • Dateigröße:
  • 13.40MB

Bowtie für Linux. Stichworte


Bowtie für Linux. Beschreibung

Anzeige Bowtie for Linux ist eine von Ben Langmead entwickelte Heim- und Bildungssoftware. Nach unserem Test- und Test ist die Software als offiziell, sicher und kostenlos erwiesen. Hier ist die offizielle Beschreibung für Bowtie für Linux: Bearbeiten von Bowtie for Linux ist ein ultraschneller, erinnerungs-effizienter kurzer Lesezeichen. Es richtet sich mit kurzen DNA-Sequenzen (liest) an das menschliche Genom mit einer Rate von 25 Millionen Lese pro Stunde an einer typischen Workstation mit 2 Gigabyte des Erachtens aus. Bowtie indiziert das Genom mit einem Burrows-Wheeler-Index, um den Memory-Footprint klein zu halten: 1,3 GB für das menschliche Genom. Es unterstützt die Ausrichtungsrichtlinien, die Maq und SOAP entspricht, ist jedoch viel schneller: etwa 35x schneller als Maq und über 350x schneller als Seife, wenn sie an das menschliche Genom ausgerichtet sind. Merkmale: Alle bekannten Probleme mit den Optionen von --unfa / - Unfq behoben: Sie arbeiten jetzt ordnungsgemäß mit mehreren Threads. Problem wurde festgelegt, wo die Reihenfolge und Quals manchmal umgekehrt wurden. Andere Probleme behoben, die uneingeschränkte Löwe verursachen. --MAXFA / - MAXFQ-Optionen, sodass die Lesevorgänge hinzugefügt werden, die nicht aufgrund der M -M-Grenze ausgerichtet werden, können gesondert von den Reads abgeladen werden, die überhaupt nicht ausgerichtet sind. Die Ausrichtung der Ausrichtung ist jetzt garantiert "deterministisch", auch wenn mehrere Threads verwendet werden. D. H. In Anbetracht derselben Eingangslesen (in beliebiger Reihenfolge) und derselben -, wird Bowtie jedes Mal die gleichen Ausrichtungen erstellen, wenn sie nicht unbedingt in derselben Reihenfolge ist. Dies gilt nicht über verschiedene Versionen von Bowtie. Mehrere andere Fehlerbehebungen.


Bowtie für Linux. Zugehörige Software

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