Blastalign.

wird Nukleotidsequenzen ausrichten
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Blastalign. Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Name des Herausgebers:
  • Aris Katzourakis
  • Betriebssysteme:
  • Windows All
  • Dateigröße:
  • 180 KB

Blastalign. Stichworte


Blastalign. Beschreibung

Die BLASTALIGN-Anwendung verwendet NCBI-BLAST, um Nukleotidsequenzen auszurichten, die große Indizenzen (Einfügungen / Löschungen) aufweisen oder sonst schwierig sind, global auszurichten. Das Programm wählt die repräsentative Sequenz von den Eingangssequenzen aus und extrahiert anschließend die BLAST-Abfrage, die mehrere Ausrichtungen (in Nexus- und Phylip-Formaten) verankert ist. Alternativ kann der Benutzer auswählen, welche Reihenfolge als Anker verwendet werden soll. Das Programm gibt auch eine Matrix aus, die Regionen der Homologie entlang der Sequenzen darstellt, die zum visuellen Identifizieren von Untergruppen verwendet werden können, die bestimmte große Indanzel teilen. BLASTALIGNP ein zusätzliches Programm verwendet Tblasten, um Nukleotidsequenzen an eine einzelne Aminosäurereferenzfolge auszurichten, so dass ein offener Leserahmen in der Mehrfachausrichtung aufrechterhalten wird.


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