Blast2go. Analysieren Sie einfach Ihre Anmerkungsdaten
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Blast2go. Ranking & Zusammenfassung

Blast2go. Stichworte

Analyse Anmerkung Reihenfolge Sequenz Annotation Blastanalyse

Blast2go. Beschreibung

BLAST2GO ist ein leistungsfähiges Programm, mit dem Sie Sequenzen und Sequenzanalyse annotieren können. Die Software ist eine geeignete Lösung für das Feld Bioinformatics, da er umfassende Werkzeuge für die funktionale Anmerkung von Sequenzen bietet. Mit anderen Worten, Sie können Informationen zu den biologischen Funktionen der Proteinsequenzen anbringen. Es ist eine java-basierte unabhängige Plattform, mit der Sie umfassende Datenanalyse durchführen können. Die Software kann auf Online-Datenbanken oder Informationsbibliotheken zugreifen, wodurch Daten vergleichen oder angehängt werden können. Darüber hinaus erleichtert es die schnelle Anmerkung eines großen Datensatzes, indem funktionelle Etiketten von bereits analysierten Daten an ähnliche Sets übertragen wird. Die Anwendung bietet auch mehrere Werkzeuge zur statistischen Analyse oder zur Datenvisualisierung. Mit der Anwendung können Sie BLAST-Tests, Interpro-Scans oder Daten-Mapping durchführen, bevor Sie eine große Reihe von Anmerkungen hinzufügen und statistische Diagramme generieren. Die Informationsplatten am unteren Rand des Fensters zeigen den Fortschritt mehrerer Prozesse, die parallel laufen, sowie das Analyseergebnis. Laden, Analysieren und exportieren datablast2go Ermöglicht das Laden gesamte Projekte, Sequenzen, Analyseergebnisse, Gensymboleliste oder Anmerkungen sowie einfach exportieren von Datasets. Die Analyse impliziert den Vergleich mit Online-Diensten. Zum Beispiel kann der Proteinstrahl über Cloudblast, NCBI, AWS oder LOCAL BLAY durchgeführt werden. Sie können auch eine InterProscan ausführen, mit einer der verfügbaren Anwendungen oder zur Abbildung der Blast-Hits für jede Reihenfolge. Der Anmerkungsvorgang impliziert, dass Sie mehrere Parameter einstellen, z. B. E-Wert-Trefferfilter, HSP-Treffer-Abdeckung oder Rechenanalyse-Evidenz-Codes. Die Ergebnisse der Annotierung der Sequenzen werden in der Hauptschnittstelle in der Hauptschnittstelle angezeigt, unter der Länge, Anzahl der Treffer, E-Wert, SIM-Bedeuten, Go-Treffer, Go-Liste, Enzymliste und Interpro-Scan. Diagramme und AnalyseergebnisseBlast2go können eine Reihe von Diagrammen in der Registerkarte angezeigt, in der Registerkarte in der Umgebung unterhalb der Haupttabelle. Verteilungsdiagramme können für E-Werte, Sequenzähnlichkeit, Arten und vieles mehr generiert werden. Zusätzlich wird jeder Sequenzeintrag automatisch angemessen, um die Datenquelle anzuzeigen. Die Software ist ein geeignetes Werkzeug für BIO-Ingenieure, die das Verhalten von Genen und Proteinen untersuchen, indem er experimentiert. Bewertet von Elizabeta Virlan, zuletzt am 23. Dezember 2014 aktualisiert,

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