Bayescan ist eine einfache, benutzerfreundliche Anwendung, die speziell entwickelt wurde, um den Kandidatenloci unter natürlicher Auswahl aus genetischen Daten zu identifizieren, wobei Unterschiede in Allelfrequenzen zwischen den Bevölkerungen verwendet werden. Bayescan basiert auf dem Multinomial-Dirichlet-Modell. Einer der einfachsten möglichen Szenarien besteht aus einem Inselmodell, in dem Subpopulation Allelfrequenzen durch einen gemeinsamen Migrant-Genpool korreliert werden, von dem sie sich in unterschiedlichem Grad unterscheiden. Der Unterschied in der Allelfrequenz zwischen diesem gemeinsamen Genpool und jeder Subpopulation wird durch einen subpakulierenden spezifischen FST-Koeffizienten gemessen. Daher kann diese Formulierung realistische ökologische Szenarien in Betracht ziehen, bei denen die wirksame Größe und die Einwanderungsrate zwischen Subpopulationen abweichen können.
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