4sale.

ein Werkzeug zur synchronen RNA-Sequenz und der Sekundärstrukturausrichtung und -bearbeitung
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4sale. Ranking & Zusammenfassung

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  • Dimension4
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4sale. Stichworte


4sale. Beschreibung

In der Reihenfolgeanalyse errichtet die mehrfache Ausrichtung die Fundament aller Verfahrensanalysen. Fehler in einer Ausrichtung könnten alle nachfolgenden Analysen stark beeinflussen und könnten daher zu falschen Vorhersagen führen. Handgefertigte und handverbesserte Ausrichtungen sind notwendig und inzwischen gute gemeinsame Praxis. Für RNA-Sequenzen ist häufig die Primärsequenz sowie eine Sekundärstrukturkonsens bekannt, z. B. der klebrigen Struktur der T-RNA. In letzter Zeit werden einige Ausrichtungsditoren vorgeschlagen, die in der Lage sind, beide Informationen einzuschließen und zu modellieren. Mit dem Aufkommen einer großen Menge an zuverlässigen RNA-Sequenzen zusammen mit ihren gelösten Sekundärstrukturen (erhältlich von z. 4sale füllt diese Lücke. Die Anwendung wurde entwickelt, um eine schnelles Sequenz- und synchrone Sekundärstruktur-Ausrichtung für große Datensätze und zum ersten Mal synchron manuelle Bearbeitung ausgerichteten Sequenzen und deren sekundären Strukturen zu ermöglichen. Diese Studie beschreibt einen Algorithmus für die synchrone Ausrichtung von Sequenzen und deren assoziierten Sekundärstrukturen sowie der Hauptmerkmale von 4sale, die für weitere Analysen und Bearbeitung verwendet werden. 4Sale baut einen optimalen und eindeutigen Ausgangspunkt für jede RNA-Sequenz- und Strukturanalyse auf. 4Sale, die eine benutzerfreundliche und intuitive Schnittstelle bereitstellt, ist eine umfassende Toolbox für die RNA-Analyse, die auf Reihenfolge- und Sekundärstrukturinformationen basiert.


4sale. Zugehörige Software

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