Genodive

benutzerfreundliche Anwendung, um die Bevölkerungsgenetikanalyse durchzuführen
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Genodive Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • Freeware
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Patrick G. Meirmans
  • Website des Verlags:
  • http://www.bentleydrummer.nl/software/software/Other%20software.html
  • Betriebssysteme:
  • macOS
  • Dateigröße:
  • 7.8 MB
  • Veröffentlichungsdatum:
  • 2021-06-18 09:18:15

Genodive Stichworte


Genodive Beschreibung

Benutzerfreundliche Anwendung, um die Bevölkerungsgenetikanalyse durchzuführen Genodive ist eine benutzerfreundliche Anwendung, um die Bevölkerungsgenetikanalyse durchzuführen. Es verfügt über eine intuitive und unbrecherfreie Benutzeroberfläche, hinter der sich leistungsstarke statistische Werkzeuge befinden. Die Genodive kann genetische Daten sowie Entfernungsmatrizen und ökologische Daten bewältigen, sodass Sie Daten aus mehreren verschiedenen Quellen in eine einzelne Analyse kombinieren können. Genodive Merkmale Mehrere Analysen, die in anderen Programmen nicht verfügbar sind, wie beispielsweise amova-basierte K-Bedeutungs-Clustering, Tests für die Clonal-Reproduktion und AMOVAs für polyloide Daten sowie standardisierte Koeffizienten der Bevölkerungsdifferenzierung. Und das Beste von allen, genodiven Arbeiten auf einem Mac! Hier sind einige wichtige Merkmale von "Genodive": · Viele verschiedene Arten von Schlüsseln: Genodive Merkmale Viele verschiedene Arten statistischer Schlüsse, von denen einige in keiner anderen Bevölkerungs-Genetik-Software verfügbar sind. Zu den eingeschlossenen Schlüsseln gehören unter anderem: Eine flexible Analyse der molekularen Varianz, der Schätzung standardisierter Koeffizienten der Bevölkerungsdifferenzierung, der K-bedeutet, dass die Populationen mit einem simulierten Annäherungsansatz mit einem simulierten Annäherungsansatz, der Einzelpersonen, Tests auf die klonale Reproduktion zugewiesen werden, testet Hardy- Weinberg-Gleichgewicht, Berechnung des Hybridindex für Einzelpersonen und verschiedene Arten von Mantel-Tests. · Analysieren Sie mehrere Datensätze ... gleichzeitig! Alle macs, die heutzutage verkauft werden, enthalten mehrere Prozessorkerne. Die meisten Programme können jedoch nur einen Teil der Leistung dieser neuen Computer verwenden, da sie jeweils nur einen einzelnen Prozessor verwenden. Genodive erkennt automatisch die Anzahl der im Computer anwesenden Prozessoren und teilt längere Aufgaben über alle. Berechnungen finden immer im Hintergrund statt, sodass Sie andere Analysen durchführen können, während Sie auf die Ergebnisse einer längerer Analyse warten. · Mehrere Datenformate: Genodive kann drei verschiedene Arten von Daten verarbeiten: Markerdata (z. B. aus Mikrosatelliten), Abstandsmatrizen (z. B. paarweise genetische Entfernungen zwischen den Populationen) und generische andere Daten (z. B. die Koordinaten der Populationen), die in der kombiniert werden können statistische Schlussfolgerungen. Daten in Genodivimportimport Genodive erkennen sogar, ob MARKERDATA in der Genodive, fstat, genepop, spagedi, genetix, bayesass, struktur oder migrate format ist. · Beobachtungen leicht einschließen und ausschließen: Die meisten REAL-LEBEN-Datensätze sind weit weg von perfekt, einige Loci können schwieriger sein, zu punkten als andere, und es wird immer Menschen geben, deren DNA-Extraktion die DNA-Extraktion mit niedriger Qualitäts-DNA ergab. In den meisten Programmen bedeutet dies, dass das Programm aufgehört, das Inputfile bearbeiten und das Programm erneut mit der neuen Datei erneut starten. Genodive erleichtert es, Loci, Individuen, Klone, Ploidy-Ebenen, Populationen oder sogar ganze Gruppen von Populationen leicht aufzunehmen oder auszuschließen, so dass der Effekt dieser Ausreißer auf das Ergebnis der Analysen bewertet werden kann. · Eine klare Ansicht über Ihre Daten: Genodive verfügt über eine klare, ordnungsgemäße Benutzeroberfläche, mit der Sie einen Überblick über Ihre Daten und Analysen erleichtern. Sie können zwischen den Anzeigen Ihrer Daten als Klartext auswählen oder als Matrix anzeigen. Das Inspector-Panel zeigt die wichtigsten Informationen für die aktuellen Daten: Wie viele Personen pro Bevölkerung inbegriffen sind, die Anzahl der Populationsgruppen, die LocI enthalten sind, die Anzahl der Allele pro Ort und ein Protokoll mit den hier aufgeführten Analysen Dataset. · Umfangreiche Suchoptionen: Mit der Genodive können Sie Ihre Daten auf verschiedene Arten durchsuchen: von Allele, durch individuellen Namen, von der Bevölkerung, von Klon oder all den Kategorien gleichzeitig. Die Suche kann sehr spezifisch sein: Sie können beispielsweise alle Bevölkerungsnamen durchsuchen, die mit der Zeichenfolge "NL" oder alle Allele beginnen, die länger als 150 bp.note sind. und einige Analysen sind noch nicht vollständig umgesetzt. Wenn Sie diese Beta-Version verwenden, sind Sie an Ehre gebunden, Probleme, Fehler oder Lob zu melden, dass Sie möglicherweise den Autor haben. Was ist neu in dieser Version: · Verbesserte Kompatibilität mit Mac OS 10.6 "Snow Leopard". · Es wurde entfernt, dass der Begrüßungsbildschirm beim Start anzeigt, da dies zu Abstürzen führen kann. · Fehler beim Ablesen des GenePop-Formats behoben. · Interne Umstrukturierung von Zuweisungsverfahren.


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