Chsminer

bietet eine integrierte GUI-Umgebung zur Erkennung, Bewertung und Visualisierung von chromosomalen homologen Segmenten
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Chsminer Ranking & Zusammenfassung

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  • Rating:
  • Lizenz:
  • GPL
  • Preis:
  • FREE
  • Name des Herausgebers:
  • Shanghai Institutes for Biological Sciences
  • Website des Verlags:
  • http://www.biosino.org/
  • Betriebssysteme:
  • Mac OS X
  • Dateigröße:
  • 9 KB

Chsminer Stichworte


Chsminer Beschreibung

Bietet eine integrierte GUI-Umgebung zur Erkennung, Bewertung und Visualisierung von chromosomalen homologen Segmenten CHS wird am häufigsten von genomischen Regionen identifiziert, die eine Reihe von kolinearen homologen Genen enthalten. Eine begrenzte Anzahl unübertroffener Gene könnte in diesem Zusammenhang wegen umfangreicher Löschung und Invertierung erlaubt sein. Einige Studien haben jedoch gezeigt, dass ein konservierter Genreihenfolge für die alte Divergenz zu streng sein kann (z. B. ganze Genomvervielfältigung in der frühen Wirbeltierentwicklung), da die Geninversion eine weitere dominierende Kraft ist, um das Genom zu ernennen. Um die potenzielle Homologie vollständig auszunutzen, definiert der Chsminität CHS, die auf gemeinsam genutzten Geninhalten allein basiert.


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