Glied GHEMICAL ist ein molekulares Modellierungspaket mit GUI- und 3D-Visualisierungswerkzeugen.
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GHEMICAL ist ein molekulares Modellierungspaket mit GUI- und 3D-Visualisierungswerkzeugen. GHEMICAL ist ein Rechenchemie-Softwarepaket, das unter Gnu GPL freigesetzt ist. Dies bedeutet, dass der vollständige Quellcode des Pakets verfügbar ist, und Benutzer können das Paket frei studieren und ändern. GHEMICAL ist in C ++ geschrieben. GHEMICAL-Projekt verfügt über eine grafische Benutzeroberfläche (der auf Gnome basiert), und es unterstützt die Modelle der Quantenmechanik (semi-empirische und AB initio) und die molekularen Mechanik-Modelle (es gibt ein experimenteller Tripos 5.2-ähnliches) Kraftfeld für organische Molecke Auch ein Werkzeug für reduzierte Proteinmodelle ist enthalten. Geometrieoptimierung, molekulare Dynamik und ein großes Set von Visualisierungswerkzeugen sind derzeit verfügbar.Ghemie stützt sich auf den externen Code, um die quantenmechanischen Berechnungen bereitzustellen. Semi-empirisch. Methoden MNDO, Mindo / 3, AM1 und PM3 stammen aus dem MOPAC7-Paket (Public Domain) und sind in der Quellverteilung enthalten. Das MPQC-Paket (GNU GPL) wird verwendet, um AB-Initio-Methoden bereitzustellen: Die auf HARTREE-FOCK basierenden Methoden Die Theorie werden derzeit mit den Basissets von STO-3G bis 6-31G ** unterstützt. Der MPQC-Code ist nicht in der Quellverteilung enthalten. Um die MPQC-basierten AB-Initio-Methoden in GHEMICAL verwenden zu können, müssen Sie zuerst kompilieren und installieren das MPQC-Programm für Ihr System und kompilieren Sie dann GHEMICAL mit einigen spezifischen Einstellungen, die die Programme zusammen verknüpfen; Weitere Informationen finden Sie in der Installationsdatei. GHEMICAL enthält auch das OpenBabel-Paket zum Importieren und den Export von vielen verschiedenen Dateiformaten (sowie andere Aufgaben) .installationonce Sie haben die neueste Version heruntergeladen, Sie sollten alle Dateien aus Ihrer Archivdatei mit "tar -zxvvf gymemical-1.00.tgz extrahieren "Oder äquivalent" gunzip gymemical-1.00.tgz; teer -xvvf ghemical-1.00.tar ". Lesen Sie danach die "Installation" -File, die Sie gerade extrahiert haben, um zusätzliche Informationen zu erhalten. Was in dieser Version neu ist? Es ist kein offizieller stabiles Release wegen des neu hinzugefügten Win32-Anschlusses, der immer noch einige hinderliche Berührungen benötigt, bevor alles funktioniert.

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