BIO :: Index :: Blast BIO :: Index :: BLAST ist ein Perl-Modul mit Index-BLAST-Berichten und unterstützt das Abruf auf der Grundlage des Abfragebezugs.
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Perl-Modul Berichte Sprengen Blast-Berichte Abfrage-Beitritt.

BIO :: Index :: Blast Beschreibung

BIO :: Index :: BLAST ist ein Perl-Modul mit Index-BLAST-Berichten und unterstützt das Abrufen basierend auf dem Abfrage-Beitritt (en). BIO :: Index :: BLAST ist ein Perl-Modul mit Indexe-BLAST-Berichte und unterstützt das Abruf auf der Grundlage des Abfrage-Beitritts (s) .synopsis verwenden streng; Verwenden Sie BIO :: Index :: BLAST; meine ($ indexdatei, $ file1, $ dateie2); Mein $ Index = Neuer Bio :: Index :: Blast (-Filename => $ IndexFile, -write_flag => 1); $ Index-> make_index ($ file1, $ file2); meine $ ID; meine $ data = $ Index-> get_stream ($ ID); Mein $ BPLITE_REPORT = $ Index-> fetch_report ($ ID); drucken "Abfrage lautet", $ BPLITE_REPORT-> Abfrage, "n"; während (mein $ sbjct = $ bplite_report-> nextsbjct) {drucken $ sbjct-> name, "n"; während (mein $ hsp = $ sbjct-> nexthsp) {drucken "t E-Wert", $ hsp-> p,} drucken "n"; } Dieses Objekt ermöglicht es einem, einen Index auf einer BLAST-Datei (oder Dateien) zu erstellen und einen schnellen Zugriff auf den BLAST-Bericht für diesen Beitritt bereitzustellen. Hinweis: Für beste Ergebnisse "Verwendung streng". Anforderungen: · Perl.

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